Erinevatest fondidest toetust saanud ettevõtted, mittetulundusühingud, sihtasutused ja avaliku sektori asutused võivad vajada oma projektide audiitorkontrolli. Audit viiakse läbi kooskõlas rahvusvaheliste auditeerimisstandardite ning toetuse andja juhistega, et tagada aruandluse täpsus, toetuse nõuetekohane kasutamine ja kehtivate nõuete täitmine.

Vajadusel teostatakse ka kuludokumentide audit, mille eesmärk on kontrollida, kas projekti rahalisi vahendeid on kasutatud vastavalt toetusprogrammi reeglitele. Kontrolli tulemusena koostatakse aruanne või väljastatakse nõuetekohane dokument, mis vastab toetuse andja nõuetele.